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如何構(gòu)建高質(zhì)量的醫(yī)療大數(shù)據(jù)

  • 來源:中國信息化周報
  • 關(guān)鍵字:醫(yī)療,人工智能,更新
  • 發(fā)布時間:2019-06-28 06:39

  醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)與人工智能呈蓬勃發(fā)展的態(tài)勢。一方面,醫(yī)院互聯(lián)互通、國家與省市大數(shù)據(jù)中心的建設(shè),為醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)奠定了良好的基礎(chǔ);另一方面,個性化診斷、疾病預(yù)測與輔助決策支持系統(tǒng)等各類醫(yī)療人工智能應(yīng)用不斷涌現(xiàn)。

  構(gòu)建主數(shù)據(jù)管理庫

  醫(yī)療數(shù)據(jù)的主數(shù)據(jù)主要有病人信息和醫(yī)生信息兩類。目前,在醫(yī)院層面,各業(yè)務(wù)系統(tǒng)對病人的信息分別進(jìn)行存儲,但大型醫(yī)院都建立了臨床數(shù)據(jù)中心,為了唯一標(biāo)識一個病人,需要通過構(gòu)建病人主索引號將存儲于不同系統(tǒng)的病人關(guān)聯(lián)在一起。這里有兩個問題需要解決。第一,如何構(gòu)建EMPI。識別不同系統(tǒng)中同一個病人不同ID之間的映射關(guān)系十分困難,特別是在區(qū)域平臺上每個系統(tǒng)都有獨立的ID,導(dǎo)致這個問題更復(fù)雜了。第二,一個病人的基礎(chǔ)信息可能同時存在于醫(yī)院信息系統(tǒng)、實驗室信息管理系統(tǒng)和影像存儲與傳輸系統(tǒng)等系統(tǒng)中。而各系統(tǒng)的側(cè)重點不同,難免會造成數(shù)據(jù)填寫質(zhì)量不一致或數(shù)據(jù)未及時更新等問題。

  為此,需要在定義系統(tǒng)主數(shù)據(jù)的情況下,構(gòu)建主數(shù)據(jù)管理中央庫,解決主數(shù)據(jù)碎片問題。可以從各業(yè)務(wù)系統(tǒng)抽取數(shù)據(jù),并進(jìn)行數(shù)據(jù)融合,形成完備的主數(shù)據(jù)信息,然后再將主數(shù)據(jù)信息分發(fā)給各業(yè)務(wù)系統(tǒng),保證各業(yè)務(wù)系統(tǒng)中這些信息的準(zhǔn)確性和完整性。這樣就形成了公共的重要屬性由主數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)管理、各業(yè)務(wù)系統(tǒng)的特色 屬性由各系統(tǒng)獨立管理的模式。

  在構(gòu)建主數(shù)據(jù)管理庫時,首先需要從多個異構(gòu)的業(yè)務(wù)子系統(tǒng)中以ETL的方式抽取關(guān)鍵數(shù)據(jù),然后,利用元數(shù)據(jù)庫 對其中的編碼、描述進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。接著,由于多個業(yè)務(wù)系統(tǒng)的數(shù)據(jù)可能不一致,還需要通過匹配算法完成對數(shù)據(jù)的錯誤消除和信息融合。對于匹配不到的孤立信息,要加以監(jiān)控跟蹤,進(jìn)行人工處理。同時,以增量學(xué)習(xí)的方式不斷改進(jìn)匹配算法。最后,將歸整好的主數(shù)據(jù)信息存入主數(shù)據(jù)庫。

  在這些主數(shù)據(jù)管理的基礎(chǔ)服務(wù)之上,還可以提供諸如患者畫像等高級功能。目前患者就診時,醫(yī)生僅能夠通過患者自述的方式快速了解慢性病史、過敏史等信息。盡管可以查閱歷史檔案,但對于醫(yī)生來說很不方便。而通過對診斷等數(shù)據(jù)的分析,可以形成患者慢性病、過敏史的標(biāo)注信息,將這些信息合并到病人的主數(shù)據(jù)中形成患者畫像。患者就診時醫(yī)生可以直接讀取到這些標(biāo)注信息,從而準(zhǔn)確、快速地獲取必要信息。

  數(shù)據(jù)質(zhì)量管控子系統(tǒng)

  從數(shù)據(jù)產(chǎn)生過程來看,醫(yī)療數(shù)據(jù)質(zhì)量問題主要來源于3個方面。

  一是原始信息采集有誤差。在醫(yī)療系統(tǒng)內(nèi)數(shù)據(jù)采集主要通過手工方式錄入,在醫(yī)生或護(hù)士輸入信息的過程中,可能會有意或無意地將數(shù)據(jù)錯誤引入系統(tǒng)。二是數(shù)據(jù)融合過程發(fā)生問題。在對不同來源的數(shù)據(jù)進(jìn)行融合時,數(shù)據(jù)格式和語義可能會有誤差或不一致,導(dǎo)致融合結(jié)果有錯 。三是與數(shù)據(jù)的應(yīng)用場景不匹配。

  因此,在醫(yī)療數(shù)據(jù)治理流程中,需要了解最終的使用場景,也需要從業(yè)務(wù)系統(tǒng)的數(shù)據(jù)源頭控制質(zhì)量,并保證每個融合和加工過程的正確性。另外,當(dāng)發(fā)現(xiàn)錯誤的時候,可以實現(xiàn)自動或半自動的修正。因此,質(zhì)量管控平臺包括了數(shù)據(jù)質(zhì)量實時監(jiān)控、數(shù)據(jù)質(zhì)量后評估以及數(shù)據(jù)的自動修正。數(shù)據(jù)質(zhì)量實時監(jiān)控主要針對從業(yè)務(wù)系統(tǒng)抽取的或是從外部傳送的接口數(shù)據(jù),通常從及時性、有效性和完整性等幾個指標(biāo)監(jiān)測接口內(nèi)容本身的數(shù)據(jù)質(zhì)量問題,還需要對采集程序進(jìn)行監(jiān)控,如接口采集程序是否正常啟動、是否正常結(jié)束等。數(shù)據(jù)質(zhì)量后評估是指對融合后的數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量評估。首先從確定評價對象和范圍著手,然后選取數(shù)據(jù)質(zhì)量維度及評價標(biāo)準(zhǔn),確定質(zhì)量測度及評價方法,之后按照配置的評估指標(biāo)執(zhí)行評估,產(chǎn)生權(quán)重化的評估結(jié)果,最后生成質(zhì)量結(jié)果和報告。

  醫(yī)療大數(shù)據(jù)

  治理標(biāo)準(zhǔn)與治理能力評估

  在單獨的業(yè)務(wù)系統(tǒng)以及數(shù)據(jù)互聯(lián)互通方面,國家衛(wèi)生健康委員會已建立了相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)。但是,在醫(yī)療大數(shù)據(jù)方面,還缺乏專門的標(biāo)準(zhǔn)。需要特別指出的是,數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)包含病人、醫(yī)生、醫(yī)院等主數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),也包含檢查、疾病、用藥等數(shù)據(jù)值標(biāo)準(zhǔn)。數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)還需要對不同的醫(yī)療行為進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化的描述。為了便于人工智能應(yīng)用,對于文本數(shù)據(jù)和影像數(shù)據(jù),也應(yīng)有相應(yīng)的標(biāo)注規(guī)范。由于不同專科需要的數(shù)據(jù)字段有差別,有可能會進(jìn)一步制定??埔?guī)范??偠灾?,標(biāo)準(zhǔn)體系包含了相互關(guān)聯(lián)的多個標(biāo)準(zhǔn),覆蓋面廣,種類眾多,標(biāo)準(zhǔn)的建設(shè)不是一蹴而就的。

  除了醫(yī)療大數(shù)據(jù)治理標(biāo)準(zhǔn)外,值得一提的是醫(yī)療數(shù)據(jù)治理能力評估規(guī)范。數(shù)據(jù)治理能力評估規(guī)范可以考察企業(yè)對數(shù)據(jù)的管理能力,通過對企業(yè)的評估,可以逐步提高企業(yè)的數(shù)據(jù)治理能力。該評估標(biāo)準(zhǔn)經(jīng)過修改后也可以用在醫(yī)療領(lǐng)域。

  國內(nèi)最早啟動相關(guān)研究的機(jī)構(gòu)是全國信息技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會,該機(jī)構(gòu)于2014年開始開展相關(guān)的研究,并在2018年3月15日頒布了國家標(biāo)準(zhǔn)《數(shù)據(jù)管理能力成熟度評估模型》(GB/T 36073-2018)。該標(biāo)準(zhǔn)可以用于評估不同行業(yè)的企業(yè)的數(shù)據(jù)管理制度、手段、方法以及相關(guān)能力?!稑?biāo)準(zhǔn)》從8個關(guān)鍵過程域考察了企業(yè)管理數(shù)據(jù)的能力。過程域和過程項包括:數(shù)據(jù)戰(zhàn)略(數(shù)據(jù)戰(zhàn)略框架、數(shù)據(jù)戰(zhàn)略實施、數(shù)據(jù)戰(zhàn)略評估、數(shù)據(jù)任務(wù)效益評估)、數(shù)據(jù)治理(數(shù)據(jù)治理組織、數(shù)據(jù)制度建設(shè)、數(shù)據(jù)治理溝通)、數(shù)據(jù)架構(gòu)(組織數(shù)據(jù)模型、數(shù)據(jù)分布與整合、數(shù)據(jù)共享與應(yīng)用服務(wù)、元數(shù)據(jù)管理)、數(shù)據(jù)應(yīng)用(數(shù)據(jù)分析、數(shù)據(jù)開放共享、數(shù)據(jù)服務(wù))、數(shù)據(jù)安全(數(shù)據(jù)安全策略、數(shù)據(jù)安全保護(hù)、數(shù)據(jù)安全審計)、數(shù)據(jù)質(zhì)量(數(shù)據(jù)質(zhì)量需求、數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查、數(shù)據(jù)質(zhì)量分析、數(shù)據(jù)質(zhì)量提升)、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)(業(yè)務(wù)術(shù)語、參考數(shù)據(jù)和主數(shù)據(jù)、數(shù)據(jù)元、指標(biāo)數(shù)據(jù))、數(shù)據(jù)生命周期(數(shù)據(jù)需求、數(shù)據(jù)設(shè)計與開發(fā)、數(shù)據(jù)運維、數(shù)據(jù)退役)。評價方法主要采用評價問卷和調(diào)研訪談兩種。評價問卷是根據(jù)數(shù)據(jù)能力成熟度模型定義每個域的評價指標(biāo),并對各個指標(biāo)進(jìn)行加權(quán)平均,計算自評結(jié)果。調(diào)研訪談則是根據(jù)重點問題,對相關(guān)單位人員進(jìn)行輸入了解,準(zhǔn)備評估數(shù)據(jù)能力的真實情況。上述成熟度評價模型都將成熟度定義為5個等級。以國家標(biāo)準(zhǔn)GB/T 36073-2018為例,5個等級被定義為:初始級、受管理級、穩(wěn)健級、量化管理級和優(yōu)化級。其中,初始級是指對數(shù)據(jù)需求的管理主要在項目級體現(xiàn),沒有統(tǒng)一的管理流程,是一種被動的管理;受管理級是指組織已經(jīng)意識到數(shù)據(jù)是資產(chǎn),根據(jù)管理策略的要求制定了管理流程,指定了相關(guān)人員進(jìn)行初步管理;穩(wěn)健級是指數(shù)據(jù)已經(jīng)被當(dāng)做實現(xiàn)組織績效目標(biāo)的重要資產(chǎn),在組織層面制定了系列標(biāo)準(zhǔn)化管理流程,促進(jìn)數(shù)據(jù)管理的規(guī)范化;量化管理級是指數(shù)據(jù)被認(rèn)為是獲取競爭優(yōu)勢的重要資源,數(shù)據(jù)管理的效率能夠被量化分析和監(jiān)控;優(yōu)化級是指數(shù)據(jù)被認(rèn)為是組織生存的基礎(chǔ),相關(guān)管理流程能夠?qū)崟r優(yōu)化,能夠在行業(yè)內(nèi)進(jìn)行最佳實踐的分享。

  目前大多數(shù)醫(yī)療機(jī)構(gòu)的數(shù)據(jù)治理能力至多在受管理級,即把數(shù)據(jù)當(dāng)作重要資產(chǎn),進(jìn)行了初步的數(shù)據(jù)集成工作,制定了一定的管理流程。但是,還遠(yuǎn)遠(yuǎn)未達(dá)到穩(wěn)健級,目前的數(shù)據(jù)管理流程還遠(yuǎn)遠(yuǎn)沒有達(dá)到標(biāo)準(zhǔn)化階段,無法滿足數(shù)據(jù)管理及應(yīng)用能結(jié)合組織的業(yè)務(wù)戰(zhàn)略需求、經(jīng)營管理需求以及監(jiān)管需求。

  醫(yī)療數(shù)據(jù)治理是一個“修高速公路”的過程,人工智能和大數(shù)據(jù)挖掘應(yīng)用是“跑車”。修路是一個基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè),需要大量的投入,而且不會快速產(chǎn)生效果。但是,若沒有成功的數(shù)據(jù)治理,數(shù)據(jù)可用性就會有問題,現(xiàn)有的人工智能和大數(shù)據(jù)挖掘算法的效率和有效性就會打折扣。因此,各級醫(yī)療機(jī)構(gòu)和醫(yī)療管理部門應(yīng)投入人力物力,建立有效的數(shù)據(jù)治理機(jī)制,保障國家人工智能和大數(shù)據(jù)戰(zhàn)略的有效實施。

  阮彤 邱加輝

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