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康普森農(nóng)業(yè):基因助力種業(yè)發(fā)展

  • 來源:小康
  • 關(guān)鍵字:商業(yè)化,基因,發(fā)展
  • 發(fā)布時(shí)間:2024-05-18 11:38

  商業(yè)化育種平臺(tái)和企業(yè)都迎來了黃金發(fā)展時(shí)期,也肩負(fù)著一份責(zé)任。

  文|《小康》·中國(guó)小康網(wǎng)記者 趙狄娜

  農(nóng)業(yè)育種一直是我國(guó)整體發(fā)展的重要基礎(chǔ),當(dāng)前的育種技術(shù)正處于從基因組技術(shù)向多方面共性技術(shù)融合的4.0時(shí)代,追求更大程度的進(jìn)展及創(chuàng)新,國(guó)際種業(yè)競(jìng)爭(zhēng)態(tài)勢(shì)愈發(fā)激烈。然而,我國(guó)農(nóng)業(yè)分子育種起步晚,與歐美國(guó)家有一定的差距,需要大力建設(shè)新一代的商業(yè)化育種平臺(tái),結(jié)合高效的基因檢測(cè)技術(shù)、自動(dòng)化的表型采集和高精準(zhǔn)的數(shù)據(jù)分析能力,指導(dǎo)育種工作的進(jìn)行。因此,無論商業(yè)化育種平臺(tái)還是企業(yè)都迎來了黃金發(fā)展時(shí)期,也肩負(fù)著一份責(zé)任。

  北京康普森農(nóng)業(yè)科技有限公司(以下簡(jiǎn)稱康普森)成立于2018年,為北京康普森生物技術(shù)有限公司的全資子公司。公司致力于利用基因科技和大數(shù)據(jù)賦能中國(guó)種業(yè),為農(nóng)業(yè)企業(yè)提供全面的數(shù)據(jù)解決方案,已形成基因檢測(cè)、數(shù)據(jù)分析、種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)、育種分析平臺(tái)搭建、育種指導(dǎo)平臺(tái)和品種銷售平臺(tái)為一體的全方位產(chǎn)業(yè)布局,推動(dòng)中國(guó)種業(yè)發(fā)展,構(gòu)建精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)的新業(yè)態(tài),先后被評(píng)為國(guó)家高新技術(shù)企業(yè)、北京市專精特新中小企業(yè)、中關(guān)村高新技術(shù)企業(yè)、北京市創(chuàng)新型中小企業(yè)等。

  硬實(shí)力引領(lǐng)創(chuàng)新升級(jí)

  “康普森自始至終重視研發(fā)創(chuàng)新,作為國(guó)家種業(yè)陣型企業(yè)的創(chuàng)新主力軍,貫徹落實(shí)農(nóng)業(yè)農(nóng)村部扶持國(guó)家種業(yè)陣型企業(yè)的戰(zhàn)略部署,與我國(guó)種業(yè)發(fā)展同頻共振。”公司總經(jīng)理郝曉東表示,“我們已與國(guó)內(nèi)知名農(nóng)業(yè)類院校中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院等農(nóng)業(yè)科研單位建立了深厚的合作關(guān)系,聘任研究范疇涵蓋豬、肉雞、蛋雞、牛、羊、大豆、玉米、水稻等物種的14位院士、首席科學(xué)家等科研人員擔(dān)任康普森專家顧問。”他還進(jìn)一步介紹,除了由國(guó)內(nèi)領(lǐng)先科學(xué)家領(lǐng)銜外,康普森還以青年碩博為研發(fā)主力軍,研究生以上學(xué)歷人員占員工總?cè)藬?shù)的75%,本科及以上學(xué)歷人員占95%,團(tuán)隊(duì)人員從事農(nóng)業(yè)領(lǐng)域達(dá)十年以上,擁有豐富經(jīng)驗(yàn),涉及分子育種、數(shù)字農(nóng)業(yè)、種養(yǎng)殖、設(shè)施農(nóng)業(yè)、品牌推廣等農(nóng)業(yè)上下游行業(yè)鏈相關(guān)人才。

  在資深技術(shù)團(tuán)隊(duì)的帶領(lǐng)下,經(jīng)過多年深耕,康普森積累了百萬(wàn)級(jí)樣本數(shù)據(jù),搭建了獨(dú)立的服務(wù)器集群和基因組育種服務(wù)平臺(tái),在業(yè)內(nèi)具有很強(qiáng)的數(shù)據(jù)分析實(shí)力,積累PB級(jí)別育種數(shù)據(jù)、涵蓋了作物、畜禽、水產(chǎn)方向多個(gè)物種。據(jù)悉,康普森具有關(guān)鍵共性平臺(tái)集成優(yōu)勢(shì),擁有最全檢測(cè)平臺(tái),包括華大DNBSEQ T7、華大MGISEQ 2000、Illumina iScan、Affymetrix-Gene Titan基因芯片平臺(tái)、Agena Massarray質(zhì)譜分析平臺(tái)、KASP基因分型平臺(tái)、Real time PCR平臺(tái)等技術(shù)平臺(tái),根據(jù)不同需求、不同應(yīng)用場(chǎng)景,用于開發(fā)基于高通量測(cè)序、基因芯片、目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序、質(zhì)譜、KASP等技術(shù)平臺(tái)的產(chǎn)品研發(fā)和檢測(cè)服務(wù),可實(shí)現(xiàn)千萬(wàn)位點(diǎn)的檢測(cè)需求和應(yīng)用場(chǎng)景。年檢測(cè)通量可達(dá)200萬(wàn)樣本量,全自動(dòng)化的實(shí)驗(yàn)檢測(cè)平臺(tái)使檢測(cè)周期保障在7~10個(gè)自然日。“目前,康普森芯片產(chǎn)品已依據(jù)我國(guó)本土企業(yè)需求、育種進(jìn)展以及我國(guó)地方資源情況、育種進(jìn)展進(jìn)行多次更新和升級(jí)。”郝曉東說。

  深植于個(gè)性化芯片定制領(lǐng)域的康普森,自主研發(fā)了CAGT®靶向捕獲芯片技術(shù),擁有豐富動(dòng)植物固相和液相芯片定制服務(wù)經(jīng)驗(yàn),目前已成功開發(fā)百余款不同物種芯片,如豬“中芯一號(hào)”、肉雞“京芯一號(hào)”、蛋雞“鳳芯一號(hào)”、大豆“中豆芯一號(hào)”“中豆芯二號(hào)”等明星產(chǎn)品,廣泛應(yīng)用于科學(xué)研究以及產(chǎn)業(yè)育種,推動(dòng)了我國(guó)種質(zhì)資源保護(hù)利用及新品種/配套系的選育。近日,康普森迎來“鹿芯二號(hào)”梅花鹿100K育種芯片的成功研發(fā),這將極大促進(jìn)梅花鹿產(chǎn)業(yè)化發(fā)展升級(jí)。

  梅花鹿位居特種畜禽之首,是具有重要經(jīng)濟(jì)和文化價(jià)值的鹿科動(dòng)物之一,全身都是寶。我國(guó)是梅花鹿資源大國(guó)、養(yǎng)殖大國(guó),同時(shí)也是世界鹿產(chǎn)品第一消費(fèi)國(guó)、第一進(jìn)口國(guó)。2020年梅花鹿首次納入《國(guó)家畜禽遺傳資源目錄》,成為33個(gè)畜禽物種之一。但是,我國(guó)梅花鹿產(chǎn)業(yè)從養(yǎng)殖到產(chǎn)品開發(fā)的整個(gè)產(chǎn)業(yè)鏈都存在技術(shù)落后、管理混亂、質(zhì)量良莠不齊、技術(shù)與生產(chǎn)脫節(jié)的情況,同時(shí),梅花鹿系譜混亂、育種技術(shù)停留在表型選種階段,嚴(yán)重制約了梅花鹿產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。“為了更好促進(jìn)梅花鹿的種業(yè)創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)可持續(xù)的健康發(fā)展,充分利用現(xiàn)代分子育種技術(shù),加快提高我國(guó)梅花鹿生產(chǎn)性能,提高產(chǎn)業(yè)收益,降低育種成本,我們成功研發(fā)創(chuàng)制了‘鹿芯二號(hào)’。”郝曉東介紹。

  據(jù)悉,這一芯片以農(nóng)業(yè)農(nóng)村部特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)物遺傳育種與繁殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室-中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院特產(chǎn)研究所動(dòng)物遺傳資源青年科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)多年研究數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),基于國(guó)內(nèi)外8個(gè)梅花鹿亞種、7個(gè)梅花鹿培育品種(品系)的196個(gè)梅花鹿樣本高深度重測(cè)序數(shù)據(jù),平均測(cè)序深度>30×,位點(diǎn)來源廣泛、品種覆蓋面全、品種適用性廣;通過數(shù)據(jù)嚴(yán)格篩選和質(zhì)控,獲得分型質(zhì)量高、多態(tài)性高、染色體上均勻分布的位點(diǎn),適用于梅花鹿的遺傳改良和基礎(chǔ)研究,為其品種選育工作提供了有力的技術(shù)支撐和指導(dǎo)依據(jù)。

  這只是康普森在技術(shù)研發(fā)方面取得的累累碩果之一。在剛剛過去的2024年第一季度,康普森有多項(xiàng)“新品”頻頻發(fā)布。如中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院生物技術(shù)研究中心李炯棠研究團(tuán)隊(duì)與康普森聯(lián)合開發(fā)了一款適合于鯉選育、品種鑒定等多用途的基因育種芯片——“鯉育一號(hào)”。該芯片包含了20K個(gè)高質(zhì)量的SNP位點(diǎn),為鯉魚產(chǎn)業(yè)提質(zhì)增效,選育優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、耐粗、高抗、耐密等優(yōu)異性狀的鯉魚良種提供有力的技術(shù)支撐。又如安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)陳興勇團(tuán)隊(duì)基于長(zhǎng)期積累的番鴨性能測(cè)定數(shù)據(jù)和全基因組測(cè)序結(jié)果,開發(fā)出國(guó)內(nèi)首款番鴨育種芯片——“永強(qiáng)番鴨1號(hào)”。該芯片包含了50K個(gè)高質(zhì)量的 SNP位點(diǎn),為番鴨產(chǎn)業(yè)持續(xù)健康高速發(fā)展,選育出更加優(yōu)良的番鴨配套專用母本品系提供有力的技術(shù)支撐。

  持續(xù)推動(dòng)種業(yè)自立自強(qiáng)

  有了過硬的技術(shù)加持,康普森在產(chǎn)業(yè)推廣方面優(yōu)勢(shì)明顯。“以市場(chǎng)為導(dǎo)向,以良種為基礎(chǔ),以產(chǎn)業(yè)化經(jīng)營(yíng)為紐帶”,依據(jù)我國(guó)種業(yè)現(xiàn)狀,康普森以國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)建立了研發(fā)、生產(chǎn)、市場(chǎng)、銷售和客戶服務(wù)體系,助力產(chǎn)業(yè)不斷落地。

  豬基因組選擇育種就是其中之一??灯丈瓌?chuàng)新性研發(fā)了一系列適合我國(guó)生豬種業(yè)發(fā)展需求的基因組分子育種技術(shù),包括多個(gè)基因組育種新算法,同步自主開發(fā)了多款高效育種計(jì)算軟件,填補(bǔ)了我國(guó)在該領(lǐng)域的理論和技術(shù)空缺,構(gòu)建了國(guó)內(nèi)首個(gè)大規(guī)模豬基因組選擇參考群5萬(wàn)余頭,實(shí)現(xiàn)了3個(gè)主要應(yīng)用育種群的多個(gè)世代的高效選育,不同性狀的年遺傳進(jìn)展增加了40%~80%,顯著提升了育種群的性能水平,為實(shí)現(xiàn)我國(guó)生豬種業(yè)的自立自強(qiáng)奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

  此外,康普森加速首批白羽肉雞新品種“廣明2號(hào)”育種進(jìn)展。“廣明2號(hào)”白羽肉雞配套系等首批三個(gè)白羽肉雞新品種通過國(guó)家畜禽遺傳資源委員會(huì)審定,實(shí)現(xiàn)了我國(guó)白羽肉雞自主育種零的突破,打破了國(guó)外壟斷。

  利用基因組技術(shù),制定個(gè)性化保種方案,用基因組信息進(jìn)行精準(zhǔn)保種,不僅為自主育種提供了珍貴的材料,還開發(fā)了地方品種的商業(yè)價(jià)值。多年來,康普森利用基因組技術(shù),指導(dǎo)保種工作,挖掘種質(zhì)特異功能基因,構(gòu)建種質(zhì)評(píng)價(jià)利用體系,搭建畜禽基因組DNA特征庫(kù),對(duì)80余個(gè)地方品種進(jìn)行了保護(hù)和開發(fā)利用,并推出地方標(biāo)識(shí)產(chǎn)品鑒定服務(wù),給予每一個(gè)地方標(biāo)識(shí)產(chǎn)品專有的基因“身份證”,防范產(chǎn)品遭受冒名、質(zhì)疑的風(fēng)險(xiǎn)和損失。

  鹽池灘羊是寧夏回族自治區(qū)鹽池縣特產(chǎn),中國(guó)地理標(biāo)志產(chǎn)品。其肉質(zhì)細(xì)嫩、無膻味、味道鮮美、脂肪分布均勻;所產(chǎn)二毛裘皮是裘皮中的上品、寧夏的“五寶”之一、鹽池“三寶”之首。鹽池灘羊商標(biāo)品牌價(jià)值高達(dá)68.95億元,多次入選G20、金磚五國(guó)、上合峰會(huì)國(guó)宴。鹽池灘羊打假難度高,為此,康普森聯(lián)合了北京農(nóng)科院畜牧獸醫(yī)研究所、寧夏農(nóng)林科學(xué)院,利用全基因組重測(cè)序和生物信息學(xué)分析的方法,從灘羊的尾指、毛色、皮毛卷曲度等特異性狀中,發(fā)現(xiàn)區(qū)別于其他綿羊品種的特異性SNP基因位點(diǎn)25個(gè),構(gòu)建灘羊基因組變異的“指紋圖譜”;從基因組水平,精準(zhǔn)區(qū)分灘羊與其他地方肉羊品種資源,通過對(duì)模型的不斷優(yōu)化,開發(fā)了鹽池灘羊基因(SNP)鑒定技術(shù),形成了“樣品采取-基因檢測(cè)-結(jié)果分析-報(bào)告出具”的標(biāo)準(zhǔn)化流程,打造了屬于鹽池灘羊的“基因身份證”。與此同時(shí),還實(shí)現(xiàn)了鹽池灘羊基因檢測(cè)產(chǎn)業(yè)化落地。一是在檢測(cè)產(chǎn)品方面,打造品種特異位點(diǎn)集合,品種鑒定試劑盒;二是在知識(shí)產(chǎn)權(quán)方面,實(shí)行檢測(cè)方法專利保護(hù),享有軟件著作權(quán);三是在鑒定標(biāo)準(zhǔn)方面,形成該品種產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟,推動(dòng)和規(guī)范行業(yè)標(biāo)準(zhǔn);四是在市場(chǎng)應(yīng)用方面,協(xié)助搭建檢測(cè)工作站,出具品種證書、防止假冒,并與大型生鮮連鎖機(jī)構(gòu)合作。

  截至目前,康普森已獲得發(fā)明專利、軟件著作權(quán)、商標(biāo)等知識(shí)產(chǎn)權(quán)40余項(xiàng),自主研發(fā)的“基于SS-GBLUP方法的畜禽基因組選擇分析軟件”獲中國(guó)畜牧業(yè)博覽會(huì)科技創(chuàng)新產(chǎn)品銀獎(jiǎng),“雞SNP親子鑒定檢測(cè)試劑盒”“牛親子鑒定和個(gè)體識(shí)別檢測(cè)試劑盒”“豬血統(tǒng)鑒定靶向捕獲試劑盒”等被推薦為北京市新產(chǎn)品,“豬基因組選擇育種服務(wù)”被推薦為北京市新服務(wù),聯(lián)合完成的“廣明2號(hào)白羽肉雞新種源創(chuàng)制與育種技術(shù)體系構(gòu)建”獲中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院杰出科技創(chuàng)新獎(jiǎng)和北京市科學(xué)技術(shù)進(jìn)步一等獎(jiǎng)。

  去年,在第十三屆可持續(xù)畜牧業(yè)全球議程多方平臺(tái)會(huì)議(中國(guó)區(qū))上,郝曉東曾指出,育種技術(shù)需追求更大程度的進(jìn)展及創(chuàng)新,要大力建設(shè)新一代的商業(yè)化育種平臺(tái),結(jié)合高效的基因檢測(cè)技術(shù)、自動(dòng)化的表型采集和高精準(zhǔn)的數(shù)據(jù)分析能力,指導(dǎo)育種工作的進(jìn)行??灯丈鳛槠渲械馁?,首先是繼續(xù)發(fā)揮科技創(chuàng)新的支撐引領(lǐng)作用,高效整合各方資源,提升科技企業(yè)創(chuàng)新能力,構(gòu)建科技型企業(yè)培育新生態(tài);其次是通過科企合作共建研究平臺(tái),以增強(qiáng)公司自主科技創(chuàng)新能力為著力點(diǎn),基于科研、生產(chǎn)、銷售、科技交流、成果轉(zhuǎn)化“五位一體”的合作定位,突出“科技創(chuàng)新、技術(shù)集成、成果轉(zhuǎn)化”三大功能,推動(dòng)形成從基礎(chǔ)研究、應(yīng)用基礎(chǔ)研究、關(guān)鍵技術(shù)和產(chǎn)品研發(fā),到成果轉(zhuǎn)化應(yīng)用,上中下游相互協(xié)同促進(jìn)產(chǎn)學(xué)研用融合發(fā)展的建設(shè)局面;最后是更為重視人才引進(jìn)與培養(yǎng),有計(jì)劃地吸納多學(xué)科、多層次的技術(shù)與產(chǎn)業(yè)人才,完善人才培訓(xùn)、管理和激勵(lì)體系,構(gòu)建國(guó)際水平人才團(tuán)隊(duì),保證核心人才的穩(wěn)定。“在未來的發(fā)展中,康普森將依托先進(jìn)的測(cè)序和檢測(cè)技術(shù)、高效的信息分析能力、豐富的種質(zhì)資源、以多學(xué)科結(jié)合的新型育種創(chuàng)新體系為基礎(chǔ),為打好種業(yè)翻身仗、推動(dòng)我國(guó)由種業(yè)大國(guó)向種業(yè)強(qiáng)國(guó)奠定基礎(chǔ)。”

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