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北醫(yī)三院:大數(shù)據(jù)應(yīng)用有效支撐臨床科研

  自2009年新醫(yī)改啟動(dòng)以來,醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用一直是各大醫(yī)院探索的主要方向。一般大型三甲醫(yī)院有上百個(gè)系統(tǒng)在線運(yùn)行,這些系統(tǒng)可能來自十幾個(gè)廠商,由于缺乏信息表達(dá)、交換、處理的統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),且整個(gè)數(shù)據(jù)體量龐大、類型復(fù)雜,符合大數(shù)據(jù)的基本特征。

  而從醫(yī)院實(shí)際需求角度看,臨床業(yè)務(wù)對(duì)醫(yī)療質(zhì)量控制、科研分析研究及信息共享的需求十分迫切。當(dāng)這些來自一線的需求擺到醫(yī)院信息主管面前,對(duì)醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用的探索也正式啟航。

  破解多源異構(gòu)數(shù)據(jù)之困

  經(jīng)過十多年HIS建設(shè),北醫(yī)三院基礎(chǔ)設(shè)施和應(yīng)用系統(tǒng)已形成一定規(guī)模,陸續(xù)建成了包括門診和住院醫(yī)生工作站、檢驗(yàn)系統(tǒng)、護(hù)理系統(tǒng)、手術(shù)麻醉、影像系統(tǒng)等在內(nèi)的臨床信息系統(tǒng)。以電子病歷為核心的臨床數(shù)據(jù)已積累到一定數(shù)量級(jí)。對(duì)臨床數(shù)據(jù)的深挖利用是北醫(yī)三院當(dāng)前的重點(diǎn)工作。

  目前,北醫(yī)三院日均門診量達(dá)16000人次,醫(yī)院現(xiàn)有床位1740張,住院周轉(zhuǎn)率較快,人均住院6.37天。醫(yī)院信息化建設(shè)已初具集團(tuán)化規(guī)模優(yōu)勢(shì),醫(yī)院本部及四個(gè)分支機(jī)構(gòu)現(xiàn)有服務(wù)器近140臺(tái),業(yè)務(wù)網(wǎng)、辦公網(wǎng)終端設(shè)備近4000臺(tái),包括推車150臺(tái)、PDA300多臺(tái),此外還有HIS、CIS、OA等豐富的軟件資源。

  北醫(yī)三院信息管理中心副主任計(jì)虹認(rèn)為,針對(duì)多源異構(gòu)數(shù)據(jù)的大數(shù)據(jù)分析需要四步實(shí)現(xiàn):一是集合多個(gè)數(shù)據(jù)集,二是解決不同類型數(shù)據(jù)的融合、關(guān)聯(lián),三是按一定標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行統(tǒng)一存儲(chǔ),四是將數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合關(guān)聯(lián)分析后以不同的主題來展現(xiàn)。

  具體到北醫(yī)三院實(shí)際情況,計(jì)虹表示:“如何對(duì)六年積累的大量臨床業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)進(jìn)行有效利用,我們也做了很多嘗試性探索。在我看來,醫(yī)院數(shù)據(jù)利用系統(tǒng)的建設(shè)有三大目標(biāo):加強(qiáng)日常管理、追蹤指標(biāo)檢測以及持續(xù)的醫(yī)療質(zhì)量改進(jìn)?!?/p>

  探索臨床業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)服務(wù)

  目前,北醫(yī)三院面向臨床業(yè)務(wù)系統(tǒng)建設(shè)了臨床業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)平臺(tái)。“建設(shè)基本思路是基于HL7的臨床事件模型,消除中間件技術(shù),最終建立一個(gè)完善的架構(gòu)體系。”計(jì)虹表示,“在這個(gè)體系中,底層就是各個(gè)應(yīng)用系統(tǒng),中間是統(tǒng)一的適配器做數(shù)據(jù)整合、集中存儲(chǔ),頂層是臨床智能分析系統(tǒng)CI,對(duì)醫(yī)療質(zhì)量、運(yùn)行指標(biāo)進(jìn)行分析,最終實(shí)現(xiàn)服務(wù)臨床和管理業(yè)務(wù)的目標(biāo)。”

  據(jù)計(jì)虹介紹,北醫(yī)三院臨床業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)平臺(tái)建設(shè)分為數(shù)據(jù)整合、數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、數(shù)據(jù)分析、數(shù)據(jù)展現(xiàn)四個(gè)步驟。

  1.數(shù)據(jù)整合

  醫(yī)院數(shù)據(jù)是來自在線庫、歷史庫以及本院庫、分院庫等的異構(gòu)數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)來自HIS、LIS、EMR、NIS、PACS等不同IT服務(wù)商。數(shù)據(jù)整合的目的是通過對(duì)多源異構(gòu)數(shù)據(jù)進(jìn)行整合,將數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化,建立臨床數(shù)據(jù)中心、可監(jiān)測的分析指標(biāo)體系以及追訴體系,實(shí)現(xiàn)對(duì)多源異構(gòu)數(shù)據(jù)的有效管理。同時(shí)建立以患者為中心,以時(shí)間為邏輯關(guān)系,基于事件的連續(xù)性的數(shù)據(jù)集,實(shí)現(xiàn)異構(gòu)系統(tǒng)和異構(gòu)數(shù)據(jù)的對(duì)接。

  計(jì)虹強(qiáng)調(diào):“在建設(shè)臨床業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)平臺(tái)的過程中我們發(fā)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化的問題在醫(yī)院確實(shí)令人頭疼,缺乏標(biāo)準(zhǔn)會(huì)極大降低數(shù)據(jù)的利用率。標(biāo)準(zhǔn)化越早做,你的數(shù)據(jù)有效利用越有價(jià)值?!?/p>

  2.數(shù)據(jù)存儲(chǔ)

  基于MongoDB與Hadoop分布式大數(shù)據(jù)技術(shù)實(shí)現(xiàn)分布式的數(shù)據(jù)存儲(chǔ),為復(fù)雜的臨床數(shù)據(jù)分析構(gòu)建多個(gè)分布式數(shù)據(jù)計(jì)算節(jié)點(diǎn),更適用于臨床數(shù)據(jù)的多維表達(dá)?!巴ㄟ^在應(yīng)用中對(duì)比實(shí)體機(jī)和虛擬機(jī)的運(yùn)算,我們發(fā)現(xiàn)實(shí)體機(jī)堆疊式的運(yùn)算方式更適合大數(shù)據(jù)的運(yùn)算,要比虛擬化服務(wù)器性能高。當(dāng)然,虛擬化可提高前臺(tái)應(yīng)用的安全性,但就大數(shù)據(jù)這種分布式運(yùn)算而言,用實(shí)體機(jī)堆疊式方式效果更好?!庇?jì)虹表示。

  3.數(shù)據(jù)分析

  數(shù)據(jù)分析包括邏輯配置、分析引擎、數(shù)據(jù)封裝三個(gè)步驟。

  第一步是邏輯配置。邏輯配置需要依據(jù)個(gè)案指標(biāo)、群組指標(biāo)、分析斷面、群組數(shù)排除四大類進(jìn)行配置。

  第二步是分析引擎。分析引擎需要對(duì)關(guān)鍵臨床事件進(jìn)行鑒定,激活對(duì)于臨床個(gè)案、病歷的分析引擎來計(jì)算分析形成結(jié)果并進(jìn)行數(shù)據(jù)展現(xiàn),再基于臨床數(shù)據(jù)中心形成的臨床病歷資源的子集建立靈活的臨床或科研分析斷面,最后將結(jié)果數(shù)據(jù)封裝傳遞到前端。

  第三步是數(shù)據(jù)封裝。按照對(duì)應(yīng)的臨床事件進(jìn)行封裝,將多源數(shù)據(jù)歸集,建立數(shù)據(jù)統(tǒng)一的適配器來完成臨床數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化。數(shù)據(jù)增量的方式分別采用了兩種方式:大于30天的數(shù)據(jù)采用批量型適配的配置定時(shí)加載,小于30天的數(shù)據(jù)做在線庫的增量適配器定時(shí)增量采集,減少對(duì)在線庫的壓力。

  4.數(shù)據(jù)展現(xiàn)

  臨床數(shù)據(jù)模型是整個(gè)數(shù)據(jù)中心的基礎(chǔ),數(shù)據(jù)展現(xiàn)正是圍繞臨床事件展開的。“我們建立了包括門診、急診、處方、結(jié)算、入院等64個(gè)臨床事件,以急診的臨床事件為例:一個(gè)患者來了,他要就診、辦手續(xù)、診斷、醫(yī)囑、轉(zhuǎn)科等,要對(duì)這些事件進(jìn)行整合。將數(shù)據(jù)按時(shí)間軸展開,最終為醫(yī)院業(yè)務(wù)部門提供運(yùn)營監(jiān)測、醫(yī)療質(zhì)量、科研分析、重點(diǎn)人群等多維度展現(xiàn)?!庇?jì)虹表示。

  基于臨床業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)平臺(tái),北醫(yī)三院建立了全院級(jí)的應(yīng)用以提高醫(yī)療質(zhì)控的能力和效率,實(shí)現(xiàn)了對(duì)運(yùn)行指標(biāo)的監(jiān)測。一方面,通過建立醫(yī)療多中心,讓系統(tǒng)去考慮需要多科會(huì)診的問題;另一方面,通過建立科室級(jí)的應(yīng)用為科研提供支撐。

  整合影像異構(gòu)數(shù)據(jù)

  對(duì)醫(yī)院而言,影像數(shù)據(jù)更多是非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),包括CT、核磁、超聲、內(nèi)鏡、核醫(yī)學(xué)影像等信息,更符合大數(shù)據(jù)特征。

  “北醫(yī)三院PACS數(shù)據(jù)年增長量達(dá)15TB?!庇?jì)虹表示??缈剖摇⒖缭旱挠跋裎臋n如何實(shí)現(xiàn)統(tǒng)一管理?海量影像數(shù)據(jù)如何進(jìn)行有效整合?如何建立影像數(shù)據(jù)統(tǒng)一管理平臺(tái),實(shí)現(xiàn)更集中的展現(xiàn)形式?

  計(jì)虹介紹說:“我們搭建了一個(gè)影像數(shù)據(jù)的集中管理平臺(tái),集成了PACS、RIS、超聲、內(nèi)鏡、病案、核醫(yī)學(xué)等影像數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)了影像文檔的采集和集中管理。該系統(tǒng)基于時(shí)間軸管理,所有記錄按歷史先后順序展現(xiàn),再分類排列。這種模式的確大大方便了臨床醫(yī)生的使用。同時(shí)數(shù)據(jù)應(yīng)用平臺(tái)也能支持科研需求,可以使用關(guān)鍵詞進(jìn)行全文檢索、類似病歷的聚合等功能。未來,我們還將對(duì)協(xié)同診療、跨院區(qū)、區(qū)域化的影像互認(rèn)等領(lǐng)域進(jìn)行探索。”

  “醫(yī)院有效挖掘數(shù)據(jù)價(jià)值一定要以臨床業(yè)務(wù)來推動(dòng)數(shù)據(jù)的應(yīng)用水平。”結(jié)合數(shù)據(jù)應(yīng)用平臺(tái)建設(shè)的經(jīng)驗(yàn),計(jì)虹強(qiáng)調(diào),“系統(tǒng)好壞不僅僅是技術(shù)問題,因?yàn)閿?shù)據(jù)利用不同于前端應(yīng)用系統(tǒng),它與臨床的專業(yè)化程度息息相關(guān)。數(shù)據(jù)利用的好壞絕大部分取決于臨床管理部門的需求是否明確和細(xì)化。如果使用人員描述不清,指標(biāo)定義不明確,信息技術(shù)人員就無法配合實(shí)現(xiàn),這也會(huì)影響數(shù)據(jù)利用的有效價(jià)值。因此,管理與臨床部門有這個(gè)意識(shí)是好事,但醫(yī)院數(shù)據(jù)利用平臺(tái)建設(shè)的成功需要管理人員與臨床學(xué)科密切配合、科研人員的深入研究,才能將醫(yī)院數(shù)據(jù)挖掘與利用真正落地?!?/p>

  本報(bào)記者 洪蕾

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